计算行业工作交流社区

热门精选


Manual of the PNP_program

    bhdfagflga     阅读 3633

PNP 程序使用手册一 简介本程序基于并行有限元平台 ParallelHierarchicalGrid (PHG) 编写。主要目的为整合已有程序各种功能,可以对不同单位制,不同方程,不同变换,不同模型的电溶液中带电离子的漂移扩散过程进行模拟,拥有自适应加密和含时模拟能力,并可以通过后处理输出所需物理量,例如浓度,电势,电流,能量等等。1. 两种单位制 SI International Syst ...


modeling selective permeation in potassium channel 钾离子通道模拟

    bzlu     阅读 21513

Computational and Mathematical Approaches for Bioinformatics and Biophysics, 2018 Continuum modeling of selective ion permeation in a channel/nanopore Benzhuo Lu (卢本卓) Institute of Computational Math ...

...

蛋白质系统与跨膜离子通道系统立体网格标记策略说明

    GS     阅读 4834

蛋白质系统与跨膜离子通道系统立体网格标记策略[TOC] 立体网格标记策略简介用于有限元计算的立体网格标记分为两种:**区域标记**与**表面标记**。而**表面标记**又分为**边界标记**和**界面标记**。对于**普通的蛋白质系统**和**生物膜离子通道系统**的网格,我们给出了不同的**区域标记**,**边界与界面标记**。 区域标记为三位数,1开头标识区域,后面两位是区别的标号。 例如 ...

...

电离损伤模型的数值模拟

    mazhaocan     阅读 101

**中国科学院****数学与系统科学研究院****计算数学与科学工程计算研究所**!page 背景介绍总剂量效应(Total Ionizing Dose Effects)是指$$\gamma$$光子或高能离子在集成电路的材料中电离产生电子空穴对,电子空穴随即发生复合、扩散和漂移,最终在氧化层中形成氧化物陷阱电荷或者在氧化层与半导体材料的界面处形成界面陷阱电荷,使器件的性能降低甚至失效。一旦一个器件 ...

...

会议信息

    bzlu     阅读 7438

2019 2018年年终总结会拟定于2019年1月1718日召开。 2018年 强约束条件下集成微系统的基础科学技术问题, 2018年12月21日22日(20日报到),地点:北京大学东莞光电研究院 Computational and Mathematical Approaches for Bioinformatics and Biophysics, Dec.10 to 14 (check in ...


多重校正软件包

    hhxiexxxx     阅读 6746

可以进行多重校正(扩展子空间)方法的软件包总体介绍这里主要用来介绍可以实现多重校正算法的软件包,为了更容易使人理解算法的主要思想,我们这里采用Matlab语言来进行实现,具体的软件包名称为 FEM_MATLAB, 可以在这里下载这个软件包: [FEM_MATLAB下载地址](http://lsec.cc.ac.cn/~hhxie/Files/FEM_MATLAB.rar "FEM_MATLAB下载 ...

...

西安计算数学-离子通道

    bzlu     阅读 7331

第十一届全国计算数学年会离子通道模拟卢本卓科学院计算数学与科学工程计算研究所,国家数学与交叉科学中心,北京西安,07/21/2017内容 生物背景 电扩散PNP模型及其推广 生物分子表面/立体网格生成 有限元模拟 应用举例纳米管的电流特性及第三代基因测序技术钾离子通道的选择性通透1. Ion channel membrane system A real view of protein molec ...

...

卷积神经网络和生物视觉【视频】

    大白     阅读 12625

最近,《Nature》在线发表了英国Deep Mind团队的一篇题目为 《Vectorbased navigation using gridlike representations in artificial agents》的文章引起了很大的轰动。其最新研发出的一个人工智能程序具有类似哺乳动物一样的寻路能力,非常类似大脑中网格细胞的工作原理。人类在自然空间中游刃有余,可以轻松绕过障碍,找到自己与目 ...

...

数字之门-学术

    bzlu     阅读 12360

在线文档、演示及计算 卢本卓 科学院计算数学所 2017.12.7[TOC] Outline I:在线文档 **xyzgate及在线Markdown写作** 特点 写作 **共享功能及其它** 应用场景 主页 II:在线计算 优点: Markdown是一种可以使用普通文本编辑器编写的标记语言,通过简单的标记语法,它可以使普通文本内容具有一定的格式。Markdown的一系列衍生版本,可用于扩展Ma ...

...

"数字之门"云上实验室

    bzlu     阅读 12297

数字之门 云上实验室“数字之门”是一款基于云计算的在线“云上实验室”,为科研人员搭建云上工作环境,**加速推广面向未来的学习工作新方式**,高效安全解决计算及信息处理作业任务。“数字之门”以**在线、便捷、一站式**为特点,目前设置文档、数据、软件和集群四个功能区,涵盖云文档、服务器、软件、数据存储和分析工具等核心技术支持,可满足“云上实验室”的在线文档写作、在线计算、在线教学(育)等常规场 ...

...