计算行业工作交流社区

热门精选


会议信息

    bzlu     阅读 7496

2019 生命和物理科学中的微分方程及应用研讨会,2019年5月912日,重庆Title: Continuum modeling of selective permeation in ion channel/nanoporeAbstract: Electrodiffusion describes diffusion processes of charged particles in their ...


modeling selective permeation in potassium channel 钾离子通道模拟

    bzlu     阅读 21574

Computational and Mathematical Approaches for Bioinformatics and Biophysics, 2018 Continuum modeling of selective ion permeation in a channel/nanopore Benzhuo Lu (卢本卓) Institute of Computational Math ...

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西安计算数学-离子通道

    bzlu     阅读 7370

第十一届全国计算数学年会离子通道模拟卢本卓科学院计算数学与科学工程计算研究所,国家数学与交叉科学中心,北京西安,07/21/2017内容 生物背景 电扩散PNP模型及其推广 生物分子表面/立体网格生成 有限元模拟 应用举例纳米管的电流特性及第三代基因测序技术钾离子通道的选择性通透1. Ion channel membrane system A real view of protein molec ...

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蛋白质系统与跨膜离子通道系统立体网格标记策略说明

    GS     阅读 4914

蛋白质系统与跨膜离子通道系统立体网格标记策略[TOC] 立体网格标记策略简介用于有限元计算的立体网格标记分为两种:**区域标记**与**表面标记**。而**表面标记**又分为**边界标记**和**界面标记**。对于**普通的蛋白质系统**和**生物膜离子通道系统**的网格,我们给出了不同的**区域标记**,**边界与界面标记**。 区域标记为三位数,1开头标识区域,后面两位是区别的标号。 例如 ...

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Manual of the PNP_program

    bhdfagflga     阅读 3676

PNP 程序使用手册一 简介本程序基于并行有限元平台 ParallelHierarchicalGrid (PHG) 编写。主要目的为整合已有程序各种功能,可以对不同单位制,不同方程,不同变换,不同模型的电溶液中带电离子的漂移扩散过程进行模拟,拥有自适应加密和含时模拟能力,并可以通过后处理输出所需物理量,例如浓度,电势,电流,能量等等。1. 两种单位制 SI International Syst ...


多重校正软件包

    hhxiexxxx     阅读 6813

可以进行多重校正(扩展子空间)方法的软件包总体介绍这里主要用来介绍可以实现多重校正算法的软件包,为了更容易使人理解算法的主要思想,我们这里采用Matlab语言来进行实现,具体的软件包名称为 FEM_MATLAB, 可以在这里下载这个软件包: [FEM_MATLAB下载地址](http://lsec.cc.ac.cn/~hhxie/Files/FEM_MATLAB.rar "FEM_MATLAB下载 ...

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分子形状描述

    bzlu     阅读 1649

大分子几何形状的描述 分子的形状、表面积、体积、半径等几何量没有严格定义,也不是可观测量。研究者需要根据研究的对象和性质提出合理的定义和计算原理,然后给出适当的计算方法。当然,有一些常用的定义和计算工具也是可以在许多分子模拟软件包里找到。 关于分子半径和形状的描述可以见一篇网络文章http://sobereva.com/190对于球形分子(一般蛋白质大分子可以近似假设为球形分子),其中提到 ...


有限元电扩散模拟-南大

    bzlu     阅读 301

强约束集成微系统物理与技术全国研讨会 电扩散过程的3D有限元模拟及其应用 卢本卓 科学院计算数学与科学工程计算研究所, 国家数学与交叉科学中心,北京 厦门,12/02/2017[TOC]内容 电扩散系统应用背景 电扩散系统的自由能形式 PNP模型(连续模型) 网格生成 有限元计算: FEM应用举例 半导体器件模拟纳米管的电流特性及基因测序!page 半导体、燃料电池、离子通道、纳米孔等 ...

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3D Simulation of the Defect Generation by Hydrogen at Si-SiO_2 Interface

    mazhaocan     阅读 1164

__3D Simulation of the Defect Generation by Hydrogen at SiSiO2 Interface__[TOC] IntroductionIonizing radiation generates charge in materials, whose interfaces are regions of especially high defect de ...

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卷积神经网络和生物视觉【视频】

    大白     阅读 12664

最近,《Nature》在线发表了英国Deep Mind团队的一篇题目为 《Vectorbased navigation using gridlike representations in artificial agents》的文章引起了很大的轰动。其最新研发出的一个人工智能程序具有类似哺乳动物一样的寻路能力,非常类似大脑中网格细胞的工作原理。人类在自然空间中游刃有余,可以轻松绕过障碍,找到自己与目 ...

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